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Dr. rer. nat. Fatih Demir

Diplom Biologe

Studien

Im Rahmen meiner Diplomarbeit und Promotion beschäftigte ich mich mit der Lokalisation von bestimmten Proteinen in Membran-Nanodomänen ("Lipid Rafts") bzw. der Zusammensetzung von Detergent-Resistant Membranes (DRMs) aus Arabidopsis thaliana. Nachfolgend untersuchte ich in meinen PostDocs Membranproteinkomplexe aus tierischen Systemen im Affen/Maus/Ratten Hirn, Herz sowie einer pankreatischer Zelllinie.

Dissertation

Ziel meines Projekts war die Entschlüsselung von Signaltransduktionsprozessen durch Membran-Nanodomänen in Arabidopsis thaliana. Hierbei wurde die Proteinzusammensetzung der DRMs aus der Plasmamembran von Arabidopsis thaliana Mesophyllzellen mithilfe von verschiedenen Detergentien (Brij-98 & Triton X-100) und Techniken (Flüssig- und In-Gelverdau bzw. Steroldepletion mittels Methyl-ß-D-Cyclodextrin) untersucht.

Dies wurde bisher im pflanzlichen Bereich noch nicht an Mesophyllzellen durchgeführt, die jedoch eine wichtige Rolle bei der pflanzlichen Antwort auf Trockenstress spielen.

Die hierbei identifizierten Proteine wurden näher auf ihre Bedeutung für Transport- und Signaltransduktionsprozesse in der Pflanze physiologisch untersucht. Dabei konnte ein Proteinkomplex in Membran-Nanodomänen von Arabidopsis Mesophyllzellen identifiziert werden, der eine Rolle bei der pflanzlichen Antwort auf Trockenstress spielt. Hierbei sind Proteinkinasen, -phosphatasen und ein Anionenkanal involviert.

Diplomarbeit

Die Zielsetzung der Diplomarbeit war die Isolation von rezeptor-interagierenden Proteinen aus Arabidopsis thaliana; der untersuchte Rezeptor war hierbei der RMR-Rezeptor (receptor-like protein of the ReMembR-H2 protein family). Es konnte nachgewiesen werden, dass RMR mithilfe eines speziellen, alkaloiden Detergens solubilisiert werden kann.

Ausserdem wurde RMR per Saccharosedichtegradienten-Zentrifugation in Lipid Rafts lokalisiert.

Vermutete Interaktionsproteine für den RMR-Rezeptor konnten mithilfe von Immunopräzipitationen nicht bestätigt werden.

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